Run & Done with PaSER

PaSER 1.0

PaSER 1.0は、GPUを搭載したリアルタイムデータベース検索プラットフォームで、並列計算能力とボトムアッププロテオミクスのためのリアルタイムデータベース検索結果を提供します。

即時結果!

すぐに結果が得られます。

paser

ハイライト

PaSERは効率的に節約します

リアルタイムの結果が、現在の装置とサンプルの状態をお知らせします。

解析の時間
データベース検索には時間がかかりますが、取得が完了したらすぐに、妥協のない検索結果でこのステップを排除します。
装置の時間
PaSERでは、1分1分を大切にして、装置にかける時間を有意義なものにしています。
貴重なサンプル
貴重なサンプルを節約しましょう 単細胞でも臨床でも、PaSERのスマート機能でサンプルを無駄にしません。
コスト
装置を使う時間、試薬、サンプル調製にはコストがかかります。PaSERとRun & Doneを使用すると、意味のあるデータが得られることが保証されるため、コストを削減できます。

特長

PaSER 1.0

リアルタイムの検索結果とスマートな取得を実現した4D-プロテオミクス

PaSERが提供するリアルタイムデータベース検索とスマート取得を統合することで、データ分析のボトルネックを解消

全世界で利用可能

  • 現在および将来のtimsTOF ProとtimsTOF fleXプラットフォームはすべてPaSERにアクセス可能です。

4Dプロテオミクス

  • CCS-Awareのデータは豊富ですが、PaSERではリン酸化などのPTMを含むリアルタイムのデータベース検索が可能です。

GPUパワーで大規模並列化

  • PaSERはGPUを搭載しており、何千ものCUDAコアにまたがる大規模な計算能力を提供します。

PaSER データレビュー

  • すべてのPaSERボックスに搭載されている統合ビューアで、高度な実験情報から特定のフラグメントイオンスペクトルまで、データの詳細を自信を持って見ることができます。
スマート
  • PaSERはスマートで、サンプル収集の最後にユーザーが定義したタンパク質またはペプチドの適格性を確認することで、サンプルキューの進行状況を決定し、適合性をチェックします。

利点

PaSER 1.0

時間とコストの節約のメリット

  • 貴重なサンプルを注入する際の心配はもうありません。
  • 装置の時間を無駄にする心配はもうありません。
  • 高価な試薬やサンプルの前処理をしても、それを性能の悪いシステムに注入してしまうという心配はもうありません。
  • システムの適合性を判断するためにQCを実行するのを待つ必要はありません。
  • メソッド開発中に検索結果を待つ必要はありません。
  • 貴重なサンプル
  • 計器時間
  • 高価な試薬
  • サンプル準備時間
  • 分析時間
  • 待ち時間

8ミリ秒以内で本格的なデータベース検索が可能
PaSERのリアルタイム検索から得られる結果は、同じデータをオフラインで検索するのと同じで、一貫しています。データベース検索アルゴリズムはGPU上で実行されるため、検索時間はCPUベースの検索に比べてごくわずかです。リアルタイム検索に加えて、ペプチドーム研究を含む特定のアプリケーションのために、より広い空間を検索する機会が現実のものとなります。

驚異的な検索速度:A) ヒト細胞lysateを単回注入し、ProLuCIDまたはProLuCID-GPU検索アルゴリズムを使用して、最大6個のPTMを含むUniprot Human fastaファイルの順方向および逆方向の配列と比較。B) PaSERは平均検索時間1msでMSMSスペクトルを処理できます。C) PaSERの検索結果は、リアルタイムで行った場合でもオフラインで行った場合でも、ほぼ同じ結果が得られます。

お客様の声

" 革新的なソフトウェアツールは、質量分析で未解決の生物学的な疑問に対処するために必要不可欠なものです。トラップド・イオンモビリティ機能とtimsTOF Proの堅牢性は、多くの疾患研究に効果的に使用できる独自のボトムアップ型プロテオミクス機能を提供します。"

Professor John Yates III, the Ernest W. Hahn Professor at The Scripps Research Institute in La Jolla, California

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